1、植物茎不同：扶桑花是木本植物，属常绿灌木或小乔木；芙蓉花是草本植物，属落叶灌木或小乔木。2、花不同：扶桑花大且美丽，主要有绯红、淡红、桃红及黄白等色；芙蓉花一般指四面花，花多为白色或淡红色。3、花期不同：扶桑花花期为全年；芙蓉花的花期在10-11月。
一、植物茎不同
扶桑花是木槿花木本，为常绿灌木或小乔木；芙蓉花是草本，为落叶灌木或小乔木。
二、花不同
1、扶桑花的花药成熟后，可以看到球形的花粉粒，红色的部分是花丝，所有的花丝合成一束，叫做单体雄蕊。扶桑花的柱头五裂，上面有绒毛状的凸起，花朵又大又漂亮，花瓣五片，先端分裂，里面包含了雄蕊，只露出五分叉的花柱，几乎是最盛的，花又大又漂亮，有绯红、桃红、黄白等颜色。
2、芙蓉花（木槿属植物）一般指四面花，花初开时白色或淡红色，后变深红色，直径约8cm，花瓣近圆形，直径4-5cm，外面被毛，基部具髯毛；雄蕊柱长2.5-3cm，无毛；花柱5，疏被毛。蒴果扁球形，直径约2.5cm，被淡黄色刚毛和绵毛，果爿5。
三、花期不同
扶桑花花期全年；芙蓉花在10-11月开花，早晨开花时呈乳白色或粉红色，傍晚变成深红色。
四、生长环境
扶桑花喜欢温暖潮湿的气候，不耐寒霜，耐阴，适合在阳光充足、通风充足的地方生长，对土壤要求不严格，但在肥沃疏松的微酸性土壤中生长最好，冬季温度不低于5摄氏度；芙蓉花喜欢温暖潮湿的气候，喜欢阳光，适应性强。
五、价值
扶桑花色彩鲜艳，四季常开，主要用于园林观赏，药用具有清肺、凉血、化湿、解毒的功效；芙蓉花极美，是深秋观花的主要树种，用途广泛，树皮纤维可搓绳织布，根、花、叶均可入药。
