透骨草茎秆直立，四棱形，为绿色或淡紫色，叶片呈卵状长圆形、卵状披针形、卵状椭圆形至卵状三角形，长3-11cm，宽2-8cm，穗状花序生于茎顶及侧枝顶端，花通常多数，疏离，出自苞腋，在序轴上对生或于下部互生，花冠呈漏斗状筒形，长6.5-7.5mm，为蓝紫色、淡红色至白色，瘦果狭椭圆形，包藏于棒状宿存花萼内。
一、透骨草茎叶部位外观
1、透骨草为多年生草本植物，高30-80cm。茎秆直立，四棱形，不分枝或于上部有带花序的分枝，分枝叉开，呈绿色或淡紫色，遍布倒生短柔毛或于茎上部有展开的短柔毛，少数近无毛。
2、叶片对生，呈卵状长圆形、卵状披针形、卵状椭圆形至卵状三角形或宽卵形，草质，长3-11cm，宽2-8cm，先端渐尖、尾状急尖或急尖，稀近圆形，基部楔形、圆形或截形，中、下部叶基部常下延，边缘有5至多数钝锯齿、圆齿或圆齿状牙齿，两面散生但沿脉被有较密的短柔毛。每侧4-6条侧脉，叶柄长0.5-4cm，被短柔毛，有时上部叶柄极短或无柄。
二、透骨草花朵部位外观
1、穗状花序生于茎顶及侧枝顶端，被微柔毛或短柔毛。花序梗长3-20cm，花序轴纤细，长10-30cm。苞片呈钻形至线形，长1-2.5mm，小苞片2，生于花梗基部，与苞片同形但较小，长0.5-2mm。花通常多数，疏离，出自苞腋，在序轴上对生或于下部互生，具短梗，蕾期时直立，开放时斜展至平展，花后反折。花萼呈筒状，有五纵棱，外面常被有微柔毛，内面无毛，萼齿直立。花期萼筒长2.5-3.2mm，上方萼齿3，呈钻形，长1.2-2.3mm；下方萼齿2，三角形，长约0.3mm。
2、花冠呈漏斗状筒形，长6.5-7.5mm，为蓝紫色、淡红色至白色，外面无毛，内面于筒部远轴面被短柔毛。筒部长4-4.5mm，口部直径约1.5mm，基部上方直径约0.7mm。檐部2唇形，上唇直立，长1.3-2mm，先端2浅裂，下唇平伸，长2.5-3mm，3浅裂，中央裂片较大。雄蕊4，着生于冠筒内面基部上方2.5-3mm处，无毛。花丝狭线形，长1.5-1.8mm，远轴2枚较长。花药呈肾状圆形，长0.3-0.4mm，宽约0.5mm。雌蕊无毛。子房斜长圆状披针形，长1.9-2.2mm。花柱细长，长3-3.5mm。柱头2唇形，下唇较长，长圆形。
三、透骨草瘦果部位外观
瘦果狭椭圆形，包藏于棒状宿存花萼内，反折并贴近花序轴，萼筒长4.5-6mm，上方3萼齿，长1.2-2.3mm。种子1，基生，种皮薄膜质，与果皮合生。
