使用微生物菌剂具有改良土壤、提高肥效、增强抗逆性、防除重茬、发酵肥料、养根护根等好处。
改良土壤：有益菌可加快有机质的分解速度，促进土壤形成团粒结构，避免板结，同时还能改善它的保水、透气能力。
提高肥效：有益菌可以将土壤中的营养分解、消化成更容易被作物吸收的物质，从而提高肥料的利用率。
增强抗逆性：微生物菌剂和营养制剂并用，可相辅相成，减轻副作用。
一、微生物菌剂有哪些好处
1、改良土壤
有益菌加速土壤有机质的分解，促进土壤团粒结构形成，从而防治土壤板结，调节和改善土壤的保水、保肥、透气能力，让土壤性状更适于作物生长，同时阻断有害菌传播，能提高土壤内中微量元素的有效性，降低土壤钠盐盐分。
2、提高肥效
有益微生物能把土壤中的营养成分分解、消化，使成为容易被吸收的物质，促进作物吸收，提高肥料利用率。
3、增强抗逆性
分解输送营养物质同时，促进植物内循环，提升本身的自愈能力，与适当的药剂、营养制剂并用，启发药效，相辅相成，并减低副作用。
4、防除重茬
微生物菌能分解土壤中因重茬产生的自毒物质，微生物菌通过寄生、溶解、杀灭病菌，抗重茬。
5、发酵肥料
微生物菌剂可以使粪便温度非常快上升，快速、充分发酵腐熟。
6、养根护根
（1）作物在定植后很容易出现烧苗、闪苗、沤根现象，作物在定植前后施用一些微生物菌剂等措施进行防治。
（2）芽孢杆菌菌群、光合菌群、乳酸菌群、酵母菌群、革兰氏阳性放线菌群等八十多种有益微生物，能在作物根系周围形成一种“保护罩”，既可以有效地避免病虫害侵染作物根系，减少作物病虫害的发生。
二、使用微生物菌剂注意事项
1、高活性微生物菌剂，出现沉淀剂浑浊，胀气，偶有上层漂浮白色漂浮物均属于正常现象，摇均匀即可使用。
2、由于菌剂中含有大量的有益活菌，不能与杀菌剂、强酸强碱型制剂混合使用。
3、微生物菌剂施用时间：通常为清晨或者傍晚。切记微生物菌剂不可在阳光下直晒，阳光会sha死微生物菌。
4、菌剂要提前使用，菌剂施入土壤后有一个繁殖、杀菌的过程，需要提前使用，才可以抑制病害的发生。
5、发酵畜禽粪便时需要注意：加入微生物菌剂后，如果环境温度低于10℃，要用塑料薄膜覆盖以加速升温，发酵过程要注意供氧与翻堆。
三、微生物菌剂多久用一次
1、微生物菌剂通常可以15-20天用一次。
2、微生物菌剂在作物的整个生长周期需使用3-5次左右及以上，才可以提高肥料的吸收利用率，提高作物的产量和品质，在使用时可以配合营养类肥料，如氨基酸、黄腐酸钾、海藻精等，能加大吸收效果。
