木瓜常温贮藏法
在生产地区和产地附近销售成熟的番木瓜，包装房或转运外的贮藏只是临时，库房只求达到通风良好，清洁卫生条件即可。因为贮藏期短而不要求有冷温条件，这样，在夏热冬冷的室温下，经营者必须根据番木瓜热天后熟快，容易腐烂，而冬天后熟慢的特点，合理组织销售。秋冬季采收的成熟果实，有时还需要用人工催熟方法加速果实后熟，以便应市。催熟方法是在每一包装箱内，放入纸包滴上水的电石小量，包封包装不让透风，经1～2日夜，果皮转为鲜黄，即可食品用。 此外，也可用2 000mg/l乙烯利加两片氢氧化钠处理，24小时内即可后熟。
冬季采收的番木瓜，当地较为冷凉的大气温度，有利于果实的贮藏，若要求北运到大气温度低于12℃以下的地区，则要求运输车箱具有防冷设施，以避免果实产生冷害。
木瓜低温贮藏法
如果需较长时间贮藏，则应低温贮藏。即将经热水浸泡、熏蒸或辐照处理后的木瓜，尽快转运到大约13℃的贮库中贮存。在此温度下，木瓜一般可以贮存2～3周左右的时间，移到室温下后可正常后熟，不影响果实品质。另外注意低温贮藏木瓜最好在开始变黄的成熟阶段采收较合适，因为这个阶段果实对冷害敏感性较低。
与低温贮藏相结合的几个实验说明，低压贮藏可以减少番木瓜果实腐烂的发展，但仅是在抑制病菌的生长方面起到作用；其他一些气调贮藏是在低温下和1%～1.5%含氧量的控制气体条件下，获得延长为数不多的贮藏时间。这些实验都需要与传统的采后处理、热处理、杀菌剂处理和冷藏条件相配合，而附加的低压或气调实验提高了成本经费，故在商业实践上尚未使用。
