一、容器选择
椴树蜜要用陶瓷瓶、玻璃瓶或无毒的塑料瓶保存，绝对不能用铜、铁、铝等金属容器来保存，原因是椴树蜜含有大量的有机酸等酸性物质，若用金属容器保存这些酸性物质会与金属发生化学反应，事实上所有的蜂蜜都不能用金属容器来长期保存。
二、保存环境
椴树蜜对保存环境的要求是阴凉、干燥、清洁和通风，其中阴凉指椴树蜜不宜在阳光直射的环境下保存，干燥指椴树蜜保存环境的空气湿度不超过75%，通风指椴树蜜不能在通风不良的环境下保存，而清洁则是指椴树蜜要在干净卫生的环境下保存。
三、严格密封
椴树蜜在保存过程中一定要严格密封好，密封的主要目的是防止空气中的水分和微生物进入椴树蜜中，事实上包括椴树蜜在内的所有蜂蜜在保存时最害怕的就是混入水分，若不严格的密封则具有天然润泽性的蜂蜜会吸收空气中的水分而快速变质。
四、正确取用
1、椴树蜜取用时一定要用干净的勺子取用，若勺子不卫生则可能将微生物带入椴树蜜中，最终导致椴树蜜因微生物的大量繁殖而快速发生变质。
2、椴树蜜取用时一定要用干燥的勺子取用，若勺子上带有水分则可能使椴树蜜快速变质，原因是水会降低椴树蜜的渗透压而使微生物大量繁殖。
3、椴树蜜取用后一定要及时将容器密封好，若长时间不密封则可能导致椴树蜜提前变质，另外对于已经打开过的椴树蜜最好要在短时间内喝完。
